从人类开始开发宇宙开始进入A.C.（AfterColony）纪年，在第一个宇宙殖民地L1完成后百年，地球统一政府对殖民地以武力实行高压统治。在A.C.165宇宙住民对地球圈发起抗争，而在其中的调停者是

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。“从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决

在上一年的全国大赛中取胜的主人公·小野田坂道所属的总北高中。组建队伍的前辈们纷纷毕业、引退，作为新世代的队伍开始进发的他们，在互相刺激、支持、提升的过程中，顺利打入以连霸为目标的全国大赛。之后，决战之

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